MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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67502	NC_013205	GCC	2	6	3004962	3004967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512891
67503	NC_013205	CG	3	6	3004986	3004991	0 %	0 %	50 %	50 %	258512891
67504	NC_013205	CGA	2	6	3005049	3005054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512891
67505	NC_013205	TCC	2	6	3005111	3005116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512892
67506	NC_013205	ATCC	2	8	3005204	3005211	25 %	25 %	0 %	50 %	258512892
67507	NC_013205	GAT	2	6	3005219	3005224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512892
67508	NC_013205	T	6	6	3005255	3005260	0 %	100 %	0 %	0 %	258512892
67509	NC_013205	CGC	2	6	3005335	3005340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512893
67510	NC_013205	GTT	2	6	3005343	3005348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258512893
67511	NC_013205	GC	3	6	3005374	3005379	0 %	0 %	50 %	50 %	258512893
67512	NC_013205	TCC	2	6	3005388	3005393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512893
67513	NC_013205	TGG	2	6	3005434	3005439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512893
67514	NC_013205	CA	3	6	3005443	3005448	50 %	0 %	0 %	50 %	258512893
67515	NC_013205	CAC	2	6	3005519	3005524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512893
67516	NC_013205	CTC	2	6	3005534	3005539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512893
67517	NC_013205	AGC	2	6	3005550	3005555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512893
67518	NC_013205	ATG	2	6	3005565	3005570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512893
67519	NC_013205	TGCG	2	8	3005631	3005638	0 %	25 %	50 %	25 %	258512893
67520	NC_013205	AGT	2	6	3005641	3005646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512893
67521	NC_013205	ACC	2	6	3005922	3005927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512893
67522	NC_013205	TCG	2	6	3005984	3005989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512893
67523	NC_013205	ACA	2	6	3006016	3006021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258512893
67524	NC_013205	GAA	2	6	3006071	3006076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512893
67525	NC_013205	CAC	2	6	3006104	3006109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512893
67526	NC_013205	ATG	2	6	3006190	3006195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67527	NC_013205	CAT	2	6	3006199	3006204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258512894
67528	NC_013205	CGC	2	6	3006236	3006241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258512894
67529	NC_013205	TTCGA	2	10	3006265	3006274	20 %	40 %	20 %	20 %	258512894
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67531	NC_013205	GA	3	6	3006380	3006385	50 %	0 %	50 %	0 %	258512894
67532	NC_013205	TCG	2	6	3006412	3006417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512894
67533	NC_013205	CAC	2	6	3006457	3006462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512894
67534	NC_013205	TCCAG	2	10	3006491	3006500	20 %	20 %	20 %	40 %	258512894
67535	NC_013205	CCAT	2	8	3006512	3006519	25 %	25 %	0 %	50 %	258512894
67536	NC_013205	CG	3	6	3006540	3006545	0 %	0 %	50 %	50 %	258512894
67537	NC_013205	TGC	2	6	3006589	3006594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512894
67538	NC_013205	GA	3	6	3006625	3006630	50 %	0 %	50 %	0 %	258512894
67539	NC_013205	GCA	2	6	3006632	3006637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512894
67540	NC_013205	GCG	3	9	3006658	3006666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512894
67541	NC_013205	CAG	2	6	3006696	3006701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512894
67542	NC_013205	AG	3	6	3006743	3006748	50 %	0 %	50 %	0 %	258512894
67543	NC_013205	C	6	6	3006782	3006787	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67544	NC_013205	GAT	2	6	3006826	3006831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67545	NC_013205	GGC	2	6	3006924	3006929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67546	NC_013205	CAG	2	6	3006972	3006977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512895
67547	NC_013205	GCG	2	6	3006984	3006989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258512895
67548	NC_013205	TTGT	2	8	3007021	3007028	0 %	75 %	25 %	0 %	258512895
67549	NC_013205	GCTG	2	8	3007100	3007107	0 %	25 %	50 %	25 %	258512895
67550	NC_013205	CGA	2	6	3007178	3007183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258512895
67551	NC_013205	CTGGCG	2	12	3007282	3007293	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258512895
67552	NC_013205	GAA	2	6	3007295	3007300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258512895
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67554	NC_013205	CGT	2	6	3007337	3007342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512895
67555	NC_013205	TGC	2	6	3007372	3007377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512895
67556	NC_013205	GGT	2	6	3007450	3007455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258512895
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67559	NC_013205	CG	3	6	3007591	3007596	0 %	0 %	50 %	50 %	258512896
67560	NC_013205	CTC	2	6	3007597	3007602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258512896
67561	NC_013205	GGCG	2	8	3007774	3007781	0 %	0 %	75 %	25 %	258512896
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67570	NC_013205	CGGT	2	8	3008107	3008114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67571	NC_013205	GAC	2	6	3008157	3008162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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67587	NC_013205	TCGG	2	8	3009057	3009064	0 %	25 %	50 %	25 %	258512898
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67600	NC_013205	CTTC	2	8	3009764	3009771	0 %	50 %	0 %	50 %	258512899
67601	NC_013205	CG	3	6	3009797	3009802	0 %	0 %	50 %	50 %	258512899
67602	NC_013205	ATG	2	6	3009820	3009825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512899
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67605	NC_013205	CAC	2	6	3009963	3009968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258512899
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67608	NC_013205	AGGG	2	8	3010120	3010127	25 %	0 %	75 %	0 %	258512899
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67614	NC_013205	ATCGAT	2	12	3010389	3010400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258512899
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67616	NC_013205	GTC	2	6	3010456	3010461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258512899
67617	NC_013205	TGGCGA	2	12	3010484	3010495	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258512899
67618	NC_013205	TCC	2	6	3010521	3010526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67619	NC_013205	CGAA	2	8	3010535	3010542	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67620	NC_013205	CTC	2	6	3010573	3010578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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67622	NC_013205	TC	3	6	3010675	3010680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67623	NC_013205	CCT	2	6	3010690	3010695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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67640	NC_013205	TGA	2	6	3011583	3011588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258512900
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.